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拟南芥冷诱导CBF/DREB类结合因子的克隆及其生物信息学分析
拟南芥冷诱导CBF/DREB类结合因子的克隆及其生物信息学分析
作者:
刘俊
向跃武
张志勇
张志雄
王闵霞
蔡平钟
马林
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
CBF/DREB
结合因子
克隆
生物信息学
摘要:
CBF/DREB结合因子广泛存在于植物中,主要参与诸如干旱、高盐以及冷胁迫等相关基因的表达调控.以拟南芥DNA为模板,PCR扩增出3个冷诱导的CBF/DREB结合因子,即CBF1、CBF2及CBF3,利用生物信息学手段对三者的cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、功能域、进化树、二级结构及DNA保守域的三级结构等进行了较为全面的分析.结果显示,CBF1、CBF2和CBF3的氨基酸序列同源性很高,达到91.4%,且都属于亲水性蛋白,三者在理化性质以及蛋白质二级结构乃至三级结构上也极为相似.另外, CBF1和CBF2都不具跨膜结构,CBF3含有1个跨膜螺旋.
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文献信息
篇名
拟南芥冷诱导CBF/DREB类结合因子的克隆及其生物信息学分析
来源期刊
生物技术通报
学科
生物学
关键词
CBF/DREB
结合因子
克隆
生物信息学
年,卷(期)
2009,(6)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
86-90
页数
5页
分类号
Q94
字数
3435字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张志勇
四川省农业科学院生物技术核技术研究所
24
117
6.0
10.0
2
蔡平钟
四川省农业科学院生物技术核技术研究所
33
250
7.0
14.0
3
向跃武
四川省农业科学院生物技术核技术研究所
31
146
6.0
10.0
4
张志雄
四川省农业科学院生物技术核技术研究所
23
117
6.0
10.0
5
马林
西南科技大学生命科学与工程学院
53
386
11.0
17.0
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(6)
节点文献
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参考文献(1)
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引证文献(0)
二级引证文献(3)
2016(1)
引证文献(0)
二级引证文献(1)
2017(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
CBF/DREB
结合因子
克隆
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物技术通报
主办单位:
中国农业科学院农业信息研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-5464
CN:
11-2396/Q
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区中关村南大街12号
邮发代号:
18-92
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
7180
总下载数(次)
42
总被引数(次)
53964
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