肝细胞癌组织相关拷贝数扩增区域的鉴定

• 作者: 宋文芹 张世光 朱争艳 杜智 杨斌 王毅军 高英堂
• 来源期刊: 中华肿瘤杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肝肿瘤 基因扩增 多态性,单核苷酸 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2009,（8）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 566-570
• 页数: 5页
• 分类号: R73
• 字数: 3642字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0253-3766.2009.08.002

摘要

目的 确定与肝细胞癌(HCC)发生相关的基因组拷贝数变异区域.方法 采用GeneChip Human Mapping 500K单核苷酸多态性(SNP)芯片分析肝癌细胞系TJ3ZX-01中全基因组拷贝数的变异情况.根据SNP芯片分析的结果 ,利用荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR),将筛选得到的4个候选扩增区域在41例HCC组织中进行验证.结果 SNP芯片分析结果 显示,在1q21.2、1q22～23.1、7p22.1和22q13.1上存在着4个拷贝数扩增的候选区域.对序列标签位点(STS)的FQ-PCR检测结果 显示,位于1q21.2的STS RH69823位点在56.1%(23/41)的HCC组织中扩增,位于1q22～23.1的STS RH38210位点在80.5%(33/41)的HCC组织中扩增,位于7p22.1的STS RH75535位点在75.6%(31/41)的HCC组织中扩增,而位于22q13.1的STS RH57885位点仅在31.7%(13/41)的HCC组织中扩增.结论 经SNP芯片分析筛选与FQ-PCR验证的4个扩增区域中,有3个区域在超过50.0%的HCC组织中显示扩增,该区域的扩增可能与HCC的发生存在着某种联系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋文芹	南开大学生命科学学院	90	1661	22.0	38.0
2	杜智	天津市第三中心医院天津市人工细胞重点实验室	134	751	13.0	20.0
3	朱争艳	天津市第三中心医院天津市人工细胞重点实验室	49	200	8.0	10.0
4	高英堂	天津市第三中心医院天津市人工细胞重点实验室	56	319	8.0	15.0
5	王毅军	天津市第三中心医院天津市人工细胞重点实验室	92	408	11.0	14.0
6	张世光	南开大学生命科学学院	3	7	2.0	2.0
7	杨斌	天津市第三中心医院天津市人工细胞重点实验室	5	11	2.0	3.0