5.8S rDNA-ITS区片段的序列分析在坛紫菜种质鉴定中的应用

• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 坛紫菜 5.8SrDNA 转录单元内间隔区 序列分析
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 页码范围: 940-948
• 页数: 9页
• 分类号: S963
• 语种: 中文

摘要

为探讨DNA序列标记技术在坛紫菜种质鉴定中的应用,对10个野生坛紫菜种质材料的5.8S rDNA-ITS区进行PCR扩增和序列分析,结果发现扩增的片段长度在1 208～1 219 bp之间,可以分为ITS1区,5.8S区和ITS2区3个部分,其中5.8S区片段的长度完全一致,均为160 bp;1TS1区和ITS2区片段的长度也非常接近,只有几个碱基的差异.多重序列比对发现10个种质材料的ITS区(包括ITS1和ITS2)序列都存在一定差异,序列同源性在95.82%～99.73%之间,而5.8S区序列则完全一致,但与其它种紫菜的5.8S区序列有很大差异,序列同源性在79.7%～95.0%之间.由此认为5.8S rDNA-ITS区这种高度保守区和高变区交替排列的形式可以成为坛紫菜种质鉴定及系统进化分析的强有力工具.