牛山湖浮游生物群落DNA指纹结构与物种组成的关系

• 作者: 余育和 冯伟松 刘志新 吴利 张堂林 张翔 邓文娜
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 浮游生物 RAPD DGGE DNA指纹结构 物种组成 牛山湖
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 84-90
• 页数: 7页
• 分类号: Q17|Q178.1
• 字数: 5606字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5174.2009.01.010

摘要

利用RAPD及DGGE指纹技术揭示牛山湖5个采样点浮游生物群落的DNA多态性,并定性地探讨其与物种组成的关系.结果如下:(1)从40条随机引物中筛选出9条引物,共获得93条谱带,多态率为58%;各采样点所得谱带平均为67条,其中Ⅰ站最少,为61条,Ⅴ站最多,为74条;(2)PCR-DGGE指纹图谱共含102条谱带,其中原核生物56条,真核生物46条,谱带总数以Ⅲ站、Ⅳ站和Ⅴ站较多.Ⅰ站和Ⅱ站较少;(3)5个采样点共观察到62种/类浮游生物,其中Ⅰ站和Ⅱ站种类较少.Ⅲ站、Ⅳ站和Ⅴ站种类较多,分布概率在100%的种类达19种.多维尺度(MDS)分析表明:基于RAPD指纹和DGGE指纹,Ⅰ站和Ⅱ站最相似,Ⅲ站、Ⅳ站和Ⅴ站最相似;基于物种组成.Ⅳ站和Ⅴ站相似性最高,Ⅲ站和Ⅳ站次之,相对RAPD指纹和DGGE指纹,Ⅰ站和Ⅱ站相似性较低.研究表明:浮游生物群落DNA指纹结构与物种组成有一定的相关性,可能因部分物种信息的缺失导致些许偏差.