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摘要:
生物序列的比对是计算生物学中的1个基本问题.最近有些生物学家给出了RNA二级结构序列的一些3-D和4-D图形表示方法,它们能给出RNA序列的比较直观的表述.文中提出RNA二级结构序列的1种新的图形表示方法.首先依据RNA中碱基分类,将RNA二级结构序列分为8个子序列,并分别对8个子序列建立特征曲线,得到相应的数字指标,构造特征向量,用以进行比对.最后用该方法对9个不同病毒的同一段RNA二级结构序列进行比对以验证其可靠性.
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文献信息
篇名 RNA二级结构的一种新的图形表示及其应用
来源期刊 中国海洋大学学报(自然科学版) 学科 数学
关键词 RNA 图形表示 矩阵 主特征值
年,卷(期) 2009,(2) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 349-352,252
页数 5页 分类号 O29|Q617
字数 2634字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1672-5174.2009.02.027
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 赵熙强 中国海洋大学数学科学学院 18 83 4.0 8.0
2 于正刚 中国海洋大学数学科学学院 1 3 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
RNA
图形表示
矩阵
主特征值
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国海洋大学学报(自然科学版)
月刊
1672-5174
37-1414/P
大16开
青岛市松岭路238号
24-31
1959
chi
出版文献量(篇)
4553
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21
总被引数(次)
47584
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