长江中下游褶纹冠蚌10个群体CO I基因序列变异分析

• 作者: 李家乐 牛东红 白志毅 贾名静
• 来源期刊: 动物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 褶纹冠蚌 COI基因 长江中下游 遗传多样性 鄱阳湖
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 分类号: Q951
• 字数: 5482字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0250-3263.2009.01.001

摘要

以线粒体CO I基因为分子标记,对长江中下游褶纹冠蚌(Cristaria plicata)10个群体共200个个体的遗传多样性进行了研究.获得了620 bp的同源序列,A+T的平均含量为60.1%,明显高于G+C含量(39.9%),有105个核苷酸变异位点,占全部碱基数的17%,转换和颠换之比达到8.7,检测到了58个单倍型(GenBank登录号:EU698893～EU698950),Hap-5是主体单倍型,占总个体数的41%.褶纹冠蚌鄱阳湖群体(PY)平均核苷酸差异数和核苷酸多样性指数均最高,分别为25.426和0.041 01,太湖群体(TH)和衢州群体(QZ)遗传多样性参数较低.基于群体间遗传距离构建的NJ系统树中,洪泽湖内的3个群体与巢湖群体首先聚为一支,然后与由钱塘江群体、太湖群体、衙州群体和洪湖群体聚成的分支聚在一起,而后与洞庭湖群体聚在一起,最外侧一支为鄱阳湖群体.分子方差分析(AMOVA)得出群体间的遗传分化指数(Fst)为0.208 1(P<0.001),说明我国褶纹冠蚌不同群体间存在一定的遗传分化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李家乐	上海海洋大学省部共建水产种质资源挖掘与利用教育部重点实验室	91	1011	19.0	27.0
2	白志毅	上海海洋大学省部共建水产种质资源挖掘与利用教育部重点实验室	36	253	9.0	14.0
3	贾名静	上海海洋大学省部共建水产种质资源挖掘与利用教育部重点实验室	1	19	1.0	1.0
4	牛东红	上海海洋大学省部共建水产种质资源挖掘与利用教育部重点实验室	27	216	10.0	14.0