中华绒螯蟹部分基因组文库构建和微卫星位点的筛选

• 作者: 刘福军 孙效文 常玉梅 梁利群 毛瑞鑫 谷晶晶 赵莹莹 鲁翠云
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 中华绒螯蟹 微卫星 磁珠富集
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 页码范围: 129-135
• 分类号: S917
• 字数: 4617字
• 语种: 中文

摘要

利用磁珠富集和放射性杂交相结合构建了中华绒螯蟹基因组微卫星文库.并利用生物素标记的(GA)12探针进行微卫星片段的富集.将得到的片段与pGEM-T载体连接后转入DHSα大肠杆菌中,然后利用γ-32P同位素标记的(GA)12:探针进行第二次筛选.结果共获得微卫星基因组文库1 500个菌,杂交前菌落PCR检测阳性克隆率为62.5%;杂交后得到的阳性克隆为447个,占29.8%.经测序,有248个克隆含有重复次数大于5次的微卫星序列.在得到的微卫星序列中,重复单元除GA/CT外,还观察到三碱基、四碱基重复单元.根据侧翼序列没计引物164对,选择合成50对,通过优化PCR反应条件,结果有21对引物可扩增出清晰可重复的目的条带,15对具有多态性.本研究对中华绒螯蟹基因组资源的开发利用提供了相关资料.