数量性状基因的完备区间作图方法

• 作者: 王建康
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 数量性状 QTL作图 完备区间作图 加显性效应 上位型互作
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 239-245
• 页数: 7页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.00239

摘要

结合分子标记和表型数据的QTL作图已成为数量性状遗传分析的常规方法.复合区间作图是近10多年来广泛应用的一种QTL定位方法,但它在算法上有一些缺陷,致使QTL效应可能会被侧连标记区间之外的标记变量吸收,同时不同的背景标记选择方法对作图结果的影响较大,并且难以推广到上位型互作QTL的定位.针对这些问题,笔者提出完备区间作图方法.本文介绍了该方法的遗传和统计原理,并通过一个大麦加倍单倍体群体说明其在定位加性QTL和加性×加性互作QTL中的应用.完备区间作图包含两个步骤:首先利用所有标记的信息,通过逐步回归选择重要的标记变量并估计其效应;然后利用逐步回归得到的线性模型校正表型数据,通过一维扫描定位加(显)性效应QTL,通过二维扫描定位上位型互作QTL.这种作图策略简化了复合区间作图中控制背景遗传变异的过程,提高了对QTL的检测功效.