西兰花(Brassica oleracea var.italica)硫代葡萄糖苷酶基因 cDNA分子克隆及其特征分析

• 作者: 梁锦锋 沈莲清
• 来源期刊: 中国食品学报
• 学科: 工学
• 关键词: 西兰花 RACE 硫代葡萄糖苷酶 硫苷
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 7-15
• 页数: 9页
• 分类号: TS2
• 字数: 4607字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-7848.2009.01.002

摘要

目的:研究西兰花硫代葡萄糖苷酶(简称硫苷酶)cDNA的结构特征,为硫苷酶异源表达打下基础.方法:以西兰花幼苗为试材.根据同源序列法PCR扩增硫苷酶特异cDNA片段,再用3＇RACE和5＇RACE分别扩增cDNA 3＇端序列和5＇端序列,经序列拼接获得西兰花硫苷酶全长cDNA序列.利用在线蛋白质分析系统对其编码的氨基酸序列进行结构特征分析.在NCBI CDD数据库中查找保守结构域,在SWISS-MODEL上进行在线蛋白同源模建,用MEGA3.1构建NJ系统树.结果:该基因cDNA全长1830bp,含有一个1641bp的ORF及31bp的5＇端非翻译区和158bp的3＇端非翻译区,命名为BoMyr2(GenBank登录号为EU004075);编码氨基酸序列含有20个氨基酸长度的信号肽及9个天冬酰胺N末端糖基化位点,编码的蛋白分子质量(Mw)约为62.2 kD,等电点(pI)为8.71;BoMyT2推测氨基酸序列舍有糖基水解酶家族1特有的糖基水解酶结构域,其编码蛋白与PDB库中白芥硫苷酶有类似的三维结构,具有明显的β/α(TIM)桶结构;BoMyr2应归为硫苷酶基因家族的MB亚族.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈莲清	浙江工商大学食品和生物工程学院	36	429	13.0	19.0
2	梁锦锋	浙江工商大学食品和生物工程学院	2	3	1.0	1.0