猪传染性胃肠炎病毒N蛋白的二级结构和B细胞抗原表位的预测

• 作者: 姜宁朋 孙健全 王可 黄庆华
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪传染性胃肠炎病毒 二级结构 B细胞抗原表位
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 19-23
• 页数: 5页
• 分类号: S811.5
• 字数: 3136字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-1182.2009.05.005

摘要

以TGEV基因组序列为基础,运用Garnier-Robson、Chou-fasman和Karplus-Schulz方法预测猪传染性胃肠炎病毒N蛋白的二级结构.运用Kyte-Doolitte方法对N蛋白的疏水性进行了分析,Jameson-Wolf方法预测了结构蛋白的抗原指数,Emini方法预测了N蛋白的表面可能性,最后结合吴玉章的方法综合分析预测B细胞抗原表位.结果显示柔性区域主要集中在N-端第11~31、52~65、128~147、155~188、210~227、313~319、331~347区段,α-螺旋和β-折叠数量少且分散.N蛋白可能的B细胞抗原位点是N-端12~31, 154~191, 204~243,309~320,329~354区段,而这些区段内部或附近都有柔性区域存在,可作为N蛋白的抗原优势表位.本研究为TGEV抗原优势表位的试验研究和反向疫苗的研制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王可	山东省农业科学院畜牧兽医研究所	24	148	6.0	11.0
2	孙健全	山东省农业科学院畜牧兽医研究所	11	63	5.0	7.0
3	黄庆华	山东省农业科学院畜牧兽医研究所	28	145	7.0	11.0
4	姜宁朋	山东省农业科学院高新技术研究中心	2	2	1.0	1.0