黄土高原土壤中细菌群落结构多样性的PCR-DGGE分析

• 作者: 崔益斌 徐军 方昊 潘雪莲 郭晓峰 陈旸 黄晟
• 来源期刊: 生态与农村环境学报
• 学科: 地球科学
• 关键词: 黄土高原 微生物多样性 群落结构 PCR-DGGE
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 页码范围: 39-43,48
• 页数: 6页
• 分类号: Q938.1|X172
• 字数: 3813字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4831.2009.03.009

摘要

利用细菌通用引物,对从黄土高原5个地区土壤样品以及西峰剖面26个土壤样品中提取的总DNA进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,采用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对PCR产物进行分析,以揭示黄土高原土壤中细菌群落结构的多样性.针对黄土高原土壤微生物特点进行DGGE试验条件优化,获得最佳变性梯度为40%～70%,最佳电泳时间为17 h(100 V).对不同深度土壤细菌DGGE图谱的聚类分析表明,不同深度土壤细菌呈现2种不同的群落结构,推测其成因可能与季风性气候引起的温湿环境变化及冰期有关.在夏季风加强而冬季风减弱的时期,气候温暖潮湿,风化成壤作用强烈,在DGGE图谱中表现为土壤样品条带多而密;反之,风化成壤作用较弱,在DGGE图谱中表现为条带少而疏.对洛川、西峰等5个地区土壤细菌Shannon-Weiner指数的测定结果表明,Shannon-Weiner指数受条带亮度及迁移率的影响.