一株新疆维吾尔族D型乙型肝炎病毒的全基因克隆分析

• 作者: 刘霖 张跃新 汤影子 王宇明 肖琳 鲁晓擘
• 来源期刊: 中华传染病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 新疆维吾尔自治区 肝炎病毒 乙型 基因型 克隆 分子 基因扩增
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 临床论著
• 页码范围: 103-108
• 页数: 6页
• 分类号: R5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1000-6680.2009.02.012

摘要

目的 进行一株新疆维吾尔族D型HBV的全基因克隆.方法应用PCR扩增HBV全基因,进行全基因克隆,挑取阳性克隆进行序列测定,使用BioEdit和美国国立生物技术信息中心(NCBI)-BLAST工具进行生物信息学分析.结果获得1例新疆维吾尔族慢性HBV感染者D型HBV病毒株的全基因序列,其基因组全长为3174 bp,与目前D基因型参照序列比较,同源性为92%～98%,与1株来自中国的DC重组基因型(AY862865)比较,同源性为91%.进一步分析发现,该新疆病毒株与目前D基因型基因库参照序列比较,有9个碱基缺失,位于核苷酸第1760～1768位(ATTAAAGGT),即可能发生了缺失突变.氨基酸分析发现,其血清型为ayw2型.重组位点分析发现,该新疆病毒株未与其他基因型重组.该新疆株与2株来自土耳其的HBV株(AY796032和AY721605)遗传距离最近.结论成功克隆了一例维吾尔族慢性HBV感染者D型HBV病毒株的全基因序列,新疆维吾尔族D基因型HBV病毒株有其自身特点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王宇明	第三军医大学西南医院感染科	299	2460	25.0	35.0
2	鲁晓擘	新疆医科大学第一附属医院感染科	62	183	8.0	10.0
3	张跃新	新疆医科大学第一附属医院感染科	179	744	12.0	17.0
4	肖琳	新疆医科大学第一附属医院感染科	28	101	6.0	8.0
5	汤影子	第三军医大学西南医院感染科	14	146	6.0	12.0
6	刘霖	第三军医大学西南医院感染科	9	78	4.0	8.0