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盐胁迫下陆地棉耐盐品种根系的抑制消减文库构建
盐胁迫下陆地棉耐盐品种根系的抑制消减文库构建
作者:
叶武威
樊保香
王俊娟
赵云雷
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
棉花
抗逆性
耐盐基因
SSH文库
摘要:
采用抑制消减(SSH)杂交技术构建了陆地棉耐盐品种中棉所35在盐(0.4%NaCl)胁迫后1 d、3 d、5 d和7 d的混合SSH文库.文库质量检测表明,差减杂交效率较高,质量较好.随机挑选200个阳性克隆进行测序,获得160余条高质量的表达序列标签(EST).对序列进行BLAST比对及功能注释,其中有62条unigene 未获得同源性匹配, 42条与未知功能的序列同源性较高;其余56条功能已知的unigene中,与抗逆直接相关的基因有14个,占8.8%,参与新陈代谢及信号转导的基因有11条和10条, 分别占6.9%和6.3%,参与转录调控的基因8条,占5.0%.最后,对这些基因在盐胁迫中的作用进行了注释与讨论.
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转录组分析
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文献信息
篇名
盐胁迫下陆地棉耐盐品种根系的抑制消减文库构建
来源期刊
棉花学报
学科
农学
关键词
棉花
抗逆性
耐盐基因
SSH文库
年,卷(期)
2009,(5)
所属期刊栏目
研究与进展
研究方向
页码范围
339-345
页数
7页
分类号
S562.035.3
字数
5337字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1002-7807.2009.05.001
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
叶武威
中国农业科学院棉花研究所农业部棉花遗传改良重点实验室
23
333
9.0
18.0
2
王俊娟
中国农业科学院棉花研究所农业部棉花遗传改良重点实验室
32
599
13.0
24.0
3
樊保香
中国农业科学院棉花研究所农业部棉花遗传改良重点实验室
7
145
7.0
7.0
4
赵云雷
中国农业科学院棉花研究所农业部棉花遗传改良重点实验室
7
58
3.0
7.0
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研究主题发展历程
节点文献
棉花
抗逆性
耐盐基因
SSH文库
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
棉花学报
主办单位:
中国农学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1002-7807
CN:
41-1163/S
开本:
大16开
出版地:
河南省安阳市开发区黄河大道西段中棉所办公区
邮发代号:
33-63
创刊时间:
1974
语种:
chi
出版文献量(篇)
2011
总下载数(次)
0
总被引数(次)
29538
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