水稻广亲和基因S5-n的功能标记开发及其应用

• 作者: 仲维功 曹卿 杨杰 王军 陈志德
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 广亲和基因S5-n 功能标记 亚洲栽培稻 普通野生稻 杂草稻
• 年，卷（期）: 2009,（11）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 2000-2007
• 页数: 8页
• 分类号: S3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.02000

摘要

广亲和基因S5-n是能够恢复籼、粳杂种育性的基因,利用常规育种方法回交转育广亲和基因需要通过配组杂种F1,,根据F1的育性判断和选择S5-n,选育周期长,方法繁琐.因此,在广亲和遗传改良和聚合育种中需要寻找一种快速、简便的广亲和基因检测方法.本研究根据水稻广亲和基因和籼粳S-5等位基因序列存在136 bp缺失的特征,设计了InDel标记S5136.前人研究已经明确02428、Dualr、CPSL017具有S5-n,分子标记S5136 PCR扩增这3个材料的带型为缺失带型,而不携带广亲和基因S5-n的材料的带型为非缺失带型.利用该标记对3037与02428的F2群体分析表明,该标记能准确区分S5-n、S5-i纯合及杂合基因型,标记基因型符合1:2:1比例,没有发生偏分离现象.利用该标记从554份水稻品种资源(D.sativa L.)和27份普通野生稻(O.rufipogen Griff)以及24份江淮流域杂草稻资源中筛选出具有缺失带型的资源材料13份,并对其PCR产物测序证实为S5-n,对Kasalath的广亲和性进行了初步验证;从20份02428的高世代育种材料中,筛选到携带广亲和基因S5-n的恢复系2份.该标记可以用于S5-n基因资源筛选、分子标记辅助选择育种和培矮64S为母本的杂交种种子纯度鉴定.