斑茅cDNA中抗病基因同源序列的分离和表达特性分析

• 作者: 张木清 徐景升 林剑伟 许莉萍 阙友雄 陈如凯
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 斑茅 抗病基因同源序列 简并引物 定量PCR
• 年，卷（期）: 2009,（11）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 2022-2028
• 页数: 7页
• 分类号: S3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.02022

摘要

植物抗病基因具有一些特定的保守结构域.本研究根据已知植物同源抗病基因(RGAs)保守序列设计简并引物,从甘蔗近缘植物斑茅的cDNA中扩增出6条抗病基因同源序列,它们在NCBI上登录号分别为EU685835、EU685836、EU685837、EU685838、EU685839和EU685840.序列分析表明,这些RGAs均含有典型的NBS-LRR类抗病基因保守结构域P-loop、kinase-2a、kinase-3a和疏水结构域(hydrophobic domain,HD).氨基酸序列的同源性比对表明,6条RGAs序列同11条参试的抗病基因之间的同源性为8.3%～93.0%,而6条RGAs之间的氨基酸序列同源为30.5%～45.6%.另外,本实验所克隆的6条斑茅抗病基因同源序列中,kinase-2(LLVLDDVW/D)最后一个氨基酸皆为色氨酸,推测所克隆的NBS-LRR类抗病基因都属于non-TIR-NBS-LRR类.定量PCR分析表明,6条斑茅抗病基因同源序列在根、茎和叶片中组成型表达,同时这些抗病基因同源序列的表达会受外源信号分子水杨酸和过氧化氢的上调作用,可能在斑茅的抗病性中具有一定的作用.