中国汉族人群SIM2基因多态性与先天性脊柱侧凸遗传易感性的关联研究

• 作者: 吴志宏 周熹 尹若峰 王乃国 王以朋 王海 费琦 邱贵兴
• 来源期刊: 中华医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 脊柱侧凸 病例对照研究 基因型
• 年，卷（期）: 2009,（41）
• 所属期刊栏目: 脊柱外科
• 页码范围: 2888-2893
• 页数: 6页
• 分类号: R6
• 字数: 5088字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0376-2491.2009.41.003

摘要

目的 通过候选基因SIM2上功能性单核苷酸多态性(SNP)位点的筛查,探索SIM2与中国汉族人群先天性脊柱侧凸(CS)及其不同临床表型之间的关联.方法 采用病例一对照研究:127例中国汉族CS患者;127例对照为性别、年龄、民族与病例相匹配的非脊柱侧凸患者.用QIAampDNABlood Mini Kit法提取外周血样本的全基因组DNA,根据国际人类基因组单体型图计划提供的基因型数据,选取SIM2的主要功能SNPs.根据椎体畸形特点、畸形部位、畸形受累程度、有无合并肋骨畸形和椎管内畸形将病例组进一步分为不同临床表型.对所有样本应用SNPstreamUHT Genotyping系统对所选SNP位点进行基因型鉴定;进一步进行基于基因型/等位基因频率的关联分析,并用Haploview 4.1软件分析对照组SNP位点间是否存在连锁不平衡.结果 共筛选SNP1(rs2073601)、SNP2(rs2073417)和SNP3(rs2051397)3个位点,病例/对照组中等位基因频率分别为:SNP1A=13(5%)/15(6%)、SNP1C=241(95%)/239(94%),SNP2A=49(19%)/44(17%)、SNP2G=205(81%)/210(83%),SNP3C=68(27%)/58(23%)、SNP3T=186(73%)/196(77%);基因型频率分别为:SNP1AC=13(10%)/15(12%)、SNP1CC=114(90%)/112(88%),SNP2AG=49(39%)/44(35%)、SNP2GG=78(61%)/83(65%),SNP3CC=10(8%)/5(4%)、SNP3CT=48(38%)/48(38%)、SNP3TT=69(54%)/74(58%),差异均无统计学意义(均P＞0.05).SNP2和SNP3间存在连锁不平衡,但单倍体型关联分析未见阳性结果.进一步与CS临床表型的关联分析中没有发现阳性位点.结论 在中国汉族人群中,SIM2基因遗传变异可能不是引起CS及其不同临床表型的主要因素,有待于进一步研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邱贵兴	中国医学科学院北京协和医院骨科	131	1425	18.0	32.0
2	吴志宏	中国医学科学院北京协和医院骨科	54	597	11.0	23.0
3	王以朋	中国医学科学院北京协和医院骨科	68	458	10.0	18.0
4	费琦	首都医科大学附属北京友谊医院骨科	58	428	11.0	17.0
5	王海	中国医学科学院北京协和医院骨科	42	166	7.0	10.0
6	周熹	中国医学科学院北京协和医院骨科	12	54	5.0	6.0
7	尹若峰	中国医学科学院北京协和医院骨科	4	24	3.0	4.0
8	王乃国	中国医学科学院北京协和医院骨科	3	18	2.0	3.0