黑龙江野鲤细菌人工染色体基因组文库构建

• 作者: 关云涛 孙效文 耿波
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 黑龙江野鲤 细菌人工染色体(BAC) 基因组文库 超级池
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 165-172
• 页数: 8页
• 分类号: S965.116
• 字数: 6744字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2009.02.003

摘要

为了开展鲤基因组研究,深入研究遗传连锁图谱遗传标记的定位及数量性状的定位和克隆,并最终为分子育种提供服务,本实验构建了鲤的BAC基因组文库.通过采集黑龙江野鲤(Cyprinus caxpio haematopterus)全血细胞制备琼脂糖凝胶包埋块的方法获得了高分子量(HMW)DNA.通过BamHI部分酶切和PFGE电泳分离选择获得1130～300 kb的DNA片段,用电洗脱和透析的方法对产物进行浓缩和纯化.纯化的HMW DNA连接到大小为7.2 kh的克隆载体pEZ BAC上.为了评估构建的文库的质量使用一系列引物对文库进行了验证.本研究首次构建黑龙江野鲤的BAC文库,该库含有46656个克隆,插入片段大小在50～300 kh之间,平均大小在100 kb左右,覆盖鲤全基因组2.45倍,调取任一基因的概率为90070左右.获得的BAC克隆,保存在378块96孔板和27块384孔板中.建立了高效稳定的2步3维PCR筛选黑龙江野鲤BAC文库的方法.本实验为今后进一步进行鲤的功能基因定位及染色体步行、BAC-FLSH等研究工作打下重要基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙效文		6	118	6.0	6.0
2	耿波		1	6	1.0	1.0
3	关云涛		1	6	1.0	1.0