大口黑鲈MyoD基因结构和单核苷酸多态性位点的筛选

• 作者: 于凌云 叶星 李小慧 李胜杰 白俊杰
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大口黑鲈 MyoD SNPs 筛选
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 分类号: Q579.1|S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2009.01.001

摘要

采用PCR技术和基因组步移技术从大口黑鲈基因组DNA中扩增得到MyoD基因及其5′调控区序列.该基因序列全长3 797 bp,其中5′调控区长1 077 bp,MyoD基因转录区由3个外显子(分别为591、81和78 bp)和2个内含子(分别为1 077和486 bp)组成.5′调控区含有与肌肉特异性基因转录密切相关的转录调控元件E box、肌细胞增强因子2(MEF2)、肌肉特异性金属硫蛋白结合位点(MTBF)及一些转录反应调控元件(TATA box 、OCAAT box、OCT1、PRE、AP4、Pit1).运用PCR-SSCP技术和直接测序法进行大口黑鲈MyoD基因SNP位点筛选,结果表明MyoD基因序列中存在7个突变点,均位于内含子上.养殖群体中这7个突变点分析结果显示突变比例范围在0.042～0.353之间.本研究结果为SNPs位点与大口黑鲈生长性能关联分析奠定了基础.