IMP型金属β-内酰胺酶活性中心的计算机模拟分析

• 作者: 余江河 劳兴珍 吕品一 许岩 郑珩
• 来源期刊: 中国抗生素杂志
• 关键词: IMP 金属β-内酰胺酶 香农熵 同源模建 分子对接
• 年，卷（期）: 2009,（9）
• 所属期刊栏目: 遗传育种与生物合成
• 页码范围: 543-547
• 页数: 5页
• 分类号: R978.1+1
• 语种: 中文

摘要

应用信息论方法和计算机模拟的方法,对IMP型β-内酰胺酶序列及活性中心进行分析,结果表明在配体结合部位的大部分残基是高度保守的,但也有部分残基易发生变异,如32位Pro、31位Val和163位Try,这些变异是引起该酶不同变异型对β-内酰胺类抗生素水解能力不同的重要原因,在设计抑制剂时需考虑在酶高变区附近分子的柔性,以防出现新突变型而对昕设计抑制剂产生抗性.将酶和底物亚胺培南及青霉素G对接结果表明.底物与酶的结合自由能与酶的催化活性间有很好的相关性,可作为评估底物或酶抑制剂结合能力的重要评价指标.对接模型更细致地显示了酶中与底物相互作用的氨基酸残基,为酶抑制剂的合理设计奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑珩	中国药科大学药物生物信息学教研室	106	521	13.0	17.0
2	劳兴珍	中国药科大学药物生物信息学教研室	36	122	7.0	9.0
3	余江河	中国药科大学药物生物信息学教研室	16	78	4.0	8.0
4	许岩	中国药科大学药物生物信息学教研室	4	14	2.0	3.0
5	吕品一	中国药科大学药物生物信息学教研室	2	12	2.0	2.0