利用斑茅cDNA芯片研究甘蔗受黑穗病菌侵染后基因差异表达

• 作者: 张木清 张积森 徐景升 林剑伟 许莉萍 阙友雄 陈如凯
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 甘蔗 黑穗病菌 斑茅 cDNA芯片 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 940-945
• 页数: 6页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.00940

摘要

为了解甘蔗抗黑穗病的分子机制,利用斑茅干旱胁迫cDNA芯片检测了甘蔗受黑穗病菌胁迫后的基因差异表达.经杂交,在cDNA芯片的3 860个模板中,有效差异表达(Ratio值≥2.0或≤0.5)的基因为101个,其中上调55个,下调46个.部分基因的定量PCR验证表明,芯片杂交结果可靠.上调表达基因经测序、冗余序列剔除,一共获得36个unique ESTs.已知功能的22个上调表达基因,涉及多条生理代谢途径,如光合作用、离子转运和核酸代谢途径:以及多种分子水平的进程,如基因转录、蛋白质合成与修饰以及细胞信号转导等.另外,还检测到14个未知功能基因.结果表明,甘蔗对黑穗病的抗性具有复杂的机制.本研究为解释甘蔗受黑穗病菌胁迫后的基因差异表达及其网络构建奠定了基础,还为今后系统研究甘蔗对生物与非生物胁迫的响应机制提供技术支持.