辽东湾斑海豹(Phoca largha)线粒体D-loop区异质型研究初探

• 作者: 孙凡越 李云峰 赫崇波 韩家波 高祥刚 鹿志创
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 斑海豹 mtDNA控制区 串联重复序列 异质型
• 年，卷（期）: 2009,（z1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 248-261,276
• 页数: 15页
• 分类号: Q95
• 字数: 7008字
• 语种: 中文

摘要

采用PCR技术和DNA克隆测序技术,随机测定了3头斑海豹mtDNA控制区(D-loop区)csn-3上、下游1000bp左右的序列,每头斑海豹任选14个克隆菌斑进行测序,结果所得序列均无重复,得到42个单倍型.结合GenBank已发表的斑海豹mtDNA控制区序列(Phoca largha,AM181031),通过Clusta1X1.83、MEGA3.1和FastPCRv3.6等生物信息学软件进行序列比对,发现我国珍稀保护动物斑海豹个体内线粒体DNA(mtDNA)的控制区CSB-3之后存在异质型现象,且存在数目不等的串联重复序列.从分子水平进行了不同类型重复序列变化规律的研究,初探了mtDNA控制区异质型在斑海豹中的存在情况.