中国南海野生斑节对虾5个地理群体线粒体16S rRNA基因序列比较分析

• 作者: 周发林 姜永杰 江世贵 马之明 黄建华
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 斑节对虾 16SrRNA 遗传多样性 中国南海
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 页码范围: 208-214
• 页数: 7页
• 分类号: S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2009.02.006

摘要

对中国南海海域5个斑节对虾野生群体三亚群体(SY)、深圳群体(SZ)、阳江群体(YJ)、湛江群体(ZJ)、北海群体(BH)100个样品的16S rRNA 序列进行PCR扩增,并对扩增产物进行了测序.用CLUSTAL_X排序软件对测序所得的100个16S rRNA序列进行比对.通过ARLEQUIN软件对所得100个16S rRNA序列进行比较分析,共检测出28个变异位点,19种单倍型.三亚、深圳、阳江、湛江以及北海等5个野生群体的核苷酸多样性(π)依次分别为0.004 35,0.005 86,0.010 50,0.010 81,0.011 68.三亚、深圳、阳江、湛江以及北海等5个野生群体的单倍型多样性(H)依次分别为0.689 5, 0.521 1, 0.573 7, 0.600 0, 0.721 1.对5个野生群体的16S rRNA序列进行FST分析,结果表明湛江、北海群体分别与三亚、深圳两个群体有显著的遗传差异,其余群体之间的遗传差异不显著.对5个群体进行AMOVA分析结果表明,5个群体间存在显著性遗传差异.对5个群体构建分子系统树,结果表明,三亚和深圳群体之间的亲缘关系最近;北海、湛江群体与三亚、深圳群体的亲缘关系很远.实验表明,中国南海海域5个斑节对虾野生群体可以为斑节对虾的选择育种提供两个基础群体:一个是三亚、深圳野生原种基础群体;另一个是湛江和北海野生原种基础群体.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	江世贵	中国水产科学研究院南海水产研究所	100	1501	22.0	31.0
2	周发林	中国水产科学研究院南海水产研究所	46	696	17.0	24.0
4	姜永杰	中国水产科学研究院南海水产研究所	4	53	4.0	4.0
5	黄建华	中国水产科学研究院南海水产研究所	49	612	17.0	22.0
6	马之明	中国水产科学研究院南海水产研究所	23	391	12.0	19.0