肝癌细胞HepG2基因表达谱的构建与分析

• 作者: 孔亚林 张洪义 沈艳 董辉 金维荣 钱震 陈样宜
• 来源期刊: 复旦学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 基因表达谱 基因表达系列分析 HepG2 IGF2BP2基因 PEG3基因
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 页码范围: 656-660,667
• 页数: 6页
• 分类号: R397|Q949.327.1
• 语种: 中文

摘要

为从转录组水平识别HepG2与正常肝组织间的基因表达差异,寻找可能参与肝癌发生发展的重要基因,应用基因表达系列分析技术(SAGE)构建了HepG2的基因表达谱.通过DGED软件进行SAGE标签序列的注释,并与NCBI公共数据库中已有的正常肝脏数据进行比较分析,使用KEGG软件对差异表达基因进行功能分类.共发现HepG2与正常肝组织间差异表达的基因733个,其中表达上调的基因主要与MAPK信号传导通路、细胞周期、细胞粘附等相关,下调基因则主要与烟酸/烟酰胺代谢以及凝血和补体功能相关.荧光实时定量RT-PCR证实了在HepG2中表达升高的IGF2BP2和PEG3基因,在原发性肝癌中的表达亦上调(P<0.05),提示该基因可能是肝癌相关基因.