四个奥利亚罗非鱼群体的微卫星分析

• 作者: 全迎春 卢迈新 叶星 张庭 白俊杰 高风英 黄樟翰
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 奥利亚罗非鱼 微卫星 群体遗传多样性 遗传距离 Hardy-Weinberg遗传平衡
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 页码范围: 498-508
• 页数: 11页
• 分类号: Q344+.1
• 字数: 5460字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.0000.2009.30498

摘要

应用筛选到的19对微卫星引物,对四个不同来源的奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)群体(奥利亚罗非鱼83系、奥利哑罗非鱼02系、奥利亚罗非鱼05系和红色奥利亚罗非鱼)的基因组DNA进行PCR扩增,分析其群体遗传结构和亲缘关系.根据几个群体在19个位点上的PCR扩增图谱,统计计算各群体的遗传多样性指数.四个群体的平均观测遗传杂合度值在0.154-0.391间;平均预期杂合度在0.181-0.428间;平均多态信息含量值在0.1513-0.3882间,说明它们的遗传多样性水平较低.遗传偏离指数D的评估结果显示这4个群体有多个位点存在不同程度的Hardy-Weinberg遗传平衡偏离.运用MicroChecker软件进行零等位基因预测,结果显示除红色奥利亚罗非鱼群体外,其他3个群体中均可能存在零等位基因位点.各群体零等位基因的位点数分别为:83系1个,02系3个,05系7个,红奥群体为0.零等位基因位点的存在可能是导致位点发生Hardy-Weinberg遗传平衡偏离的原因之一.4个群体中,05系群体与83系群体间的遗传相似性系数最高(0.9422),遗传距离最小(0.0596),说明两者亲缘关系最近;83系群体与红奥群体的遗传相似性系数最低(0.6977),遗传距离最大(0.3599),可推断两者亲缘关系最远.根据群体间的遗传距离采用UPGMA法进行聚类,结果表明:83系首先与05系聚类为一支,然后与02系群体聚类,最后与红奥群体聚类.聚类结果说明红奥群体与其他三个群体亲缘关系最远;83系群体与05系群体亲缘关系最近,与02系群体次之.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶星	中国水产科学研究院珠江水产研究所	84	1239	20.0	31.0
2	卢迈新	中国水产科学研究院珠江水产研究所	78	1111	19.0	31.0
3	黄樟翰	中国水产科学研究院珠江水产研究所	69	652	16.0	23.0
4	高风英	中国水产科学研究院珠江水产研究所	31	345	11.0	17.0
5	张庭	中国水产科学研究院珠江水产研究所	3	43	3.0	3.0
9	全迎春	中国水产科学研究院珠江水产研究所	5	123	4.0	5.0