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摘要:
利用NBS保守结构域获得的探针及基于RecA文库富集方法的试剂盒筛选东乡野生稻液体pCAMBIA1301质粒文库,杂交筛选获得阳性克隆,在NCBI上进行BLASTN序列比对后,设计相关引物,扩增获得编码区,并利用生物信息学方法预测其编码蛋白序列,与已克隆的NBS-LRR类抗性基因建立进化树.结果分析表明,其预测蛋白除了部分氨基酸缺失及2个氨基酸不同外,与粳稻大部分序列一致,分子进化树表明其与粳稻、拟南芥RPS2基因的关系最近.
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同源序列
内容分析
关键词云
关键词热度
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文献信息
篇名 东乡野生稻RPS2类候选抗病基因的克隆与分析
来源期刊 湖南农业大学学报(自然科学版) 学科 农学
关键词 东乡野生稻 液体质粒文库 长片段高保真PCR 生物信息学
年,卷(期) 2009,(2) 所属期刊栏目 作物学
研究方向 页码范围 111-115
页数 5页 分类号 S511.903.4
字数 2947字 语种 中文
DOI
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研究主题发展历程
节点文献
东乡野生稻
液体质粒文库
长片段高保真PCR
生物信息学
研究起点
研究来源
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
湖南农业大学学报(自然科学版)
双月刊
1007-1032
43-1257/S
大16开
长沙市芙蓉区湖南农业大学内
42-157
1951
chi
出版文献量(篇)
3318
总下载数(次)
6
总被引数(次)
37061
相关基金
国家科技支撑计划
英文译名:
官方网址:http://kjzc.jhgl.org/
项目类型:重大项目
学科类型:能源
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:http://www.863.org.cn
项目类型:重点项目
学科类型:信息技术
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