基于串级质谱信息进行蛋白质数据库搜索的结果可靠性分析

• 作者: 李洪东 梁逸曾 董乃平
• 来源期刊: 分析化学
• 学科: 化学
• 关键词: 蛋白质库搜索算法 串联质谱 多变量判别分析 Decoy蛋白质序列库
• 年，卷（期）: 2009,（10）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1473-1478
• 页数: 6页
• 分类号: O6
• 字数: 4698字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-3820.2009.10.013

摘要

SEQUEST与Mascot为目前蛋白组学分析研究中使用最为广泛的蛋白质库搜索工具.尝试将Mascot与SEQUEST搜索结果进行比较,进而采用不同多变量判别方法对二者的搜索结果进行判别分析,以降低其结果的假阳性率.通过对Mascot与SEQUEST搜索结果进行比较,发现所得结果差异很大;利用多变量判别分析方法对Mascot及SEQUEST搜索结果进行判别分析,可有效提高SEQUEST结果中假阳性结果与正确结果之间的区分能力.对于Mascot搜索结果,采用多变量判别分析方法仍无法显著降低其假阳性结果,利用Decoy库搜索结果进行估计时亦存在导致错误估计的风险.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁逸曾	中南大学化学化工学院中药现代化研究中心	214	3979	33.0	51.0
2	李洪东	中南大学化学化工学院中药现代化研究中心	4	22	3.0	4.0
3	董乃平	中南大学化学化工学院中药现代化研究中心	1	4	1.0	1.0