首批海岛棉基因组来源的微卫星标记的分离、评价和定位

• 作者: 余杨 余渝 张培培 张献龙 林忠旭 王夏青
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 海岛棉 微卫星标记 遗传变异 遗传定位
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1013-1020
• 页数: 8页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01013

摘要

海岛棉(Gossypium barbadense)是世界上最重要的栽培棉种之一.海岛棉纤维品质优良,是优质棉的重要产源.为了研究海岛棉的遗传多样性,为海岛棉育种提供参考依据,从海岛棉遗传标准系中分离基因组来源的微卫星标记用于海岛棉遗传评价.采用两种方法分离微卫星标记,一是用ISSR(inter simple sequence repeat)引物扩增Pima3-79,克隆测序后从中开发微卫旱标记;二是利用简并引物扩增Pima3-79,克隆测序后从中开发微卫星标记.共挑选1 447个克隆,筛选出239个独立克隆.测序后得到214个单一序列,其中包含微卫星并可用于引物设计的序列70个,获得86对引物.86对引物用于扩增56个海岛棉材料和4个陆地棉材料,16对引物没有扩增,43对引物在所有材料中没有多态性;27对引物在海岛棉和陆地棉之间有多态性,19对引物在海岛棉中表现多态性.利用Jaccard相似系数和UPGMA方法进行聚类分析可以明显区分陆地棉和海岛棉,并且将海岛棉分为4类.14对弓l物在BC1群体中表现多态性,产生14个位点.9个位点整合到BC1连锁图的7个染色体上,4个位于A亚基因组,5个位于D亚基因组.海岛棉微卫星标记扩展了棉花微卫星标记,有助于海岛棉遗传多样性的研究,有利于棉花遗传图谱的进一步丰富.