西藏胡黄连根状茎差异表达基因的筛选及分析

• 作者: 冯燕丽 夏庆杰 张义正 谈心 马欣荣
• 来源期刊: 中山大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 西藏胡黄连 根状茎特异表达基因 抑制消减杂交 表达序列标签 同源性分析 细胞色素P450单加氧酶
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 页码范围: 76-83
• 页数: 8页
• 分类号: R96
• 字数: 793字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0529-6579.2009.02.017

摘要

西藏胡黄连是著名的濒危西藏药材, 其粗壮的根茎部是重要的合成和储存药用萜类物质器官,萜类含量显著高于叶部.为克隆西藏胡黄连根状茎和叶的差异表达基因,利用抑制消减杂交技术,构建了根状茎特定的抑制消减文库.从该SSH文库中随机挑取片段不一的阳性克隆测序,采用Blastx进行同源比对,获得了27个表达序列标签(EST),并获登录号.序列统计分析结果表明,其中有11个EST在GenBank中无同源性序列,推测可能是新基因片断.蛋白质功能分类结果表明,这些蛋白质与翻译、能量代谢、转运与结合、细胞膜合成、氨基酸生物合成及中间代谢6大类蛋白功能有关.为深入研究与萜类生物合成直接或间接相关基因,选择了长595 bp的差异表达EST序列EX172715进行了同源比对和蛋白系统进化分析.结果表明,EX172715具有细胞色素P450单加氧酶的特征结构,与拟南芥的细胞色素P450单加氧酶蛋白的同源性高于水稻和小麦.提供了一组与西藏胡黄连次生代谢相关的新基因库.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张义正	四川大学生命科学学院四川省分子生物学及生物技术重点实验室	150	2059	26.0	38.0
2	马欣荣	中国科学院成都生物研究所	35	697	13.0	26.0
3	夏庆杰	四川大学华西医学院	49	250	10.0	13.0
4	谈心	中国科学院成都生物研究所	5	149	3.0	5.0
5	冯燕丽	四川大学生命科学学院四川省分子生物学及生物技术重点实验室	1	0	0.0	0.0