亚洲玉米螟幼虫酚氧化酶原基因序列的生物信息学分析

• 作者: 冯从经 桑守亮 郭晓丽 陆剑锋 黄建华
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 亚洲玉米螟 酚氧化酶原 生物信息学分析 三级结构 同源建模
• 年，卷（期）: 2009,（10）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 1068-1077
• 页数: 10页
• 分类号: Q966
• 字数: 7232字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0454-6296.2009.10.002

摘要

酚氧化酶原PPO是昆虫免疫的关键酶,本文从牛物信息学角度对亚洲玉米螟Ostrinia furnacalis Guenee幼虫PPO进行分析,为进一步研究其高级结构与功能的关系提供理论依据.利用我们已提交到GenBank的数据,采用在线分析及MEGA4和RasMol软件对亚洲玉米螟酚氧化酶原(Of-PPO)的核苷酸和氨基酸序列、系统发生关系和蛋白质三级结构进行分析.结果表明:Of-PPO全长cDNA序列有2 686 bp,包含一个2 079 bp的开放阅读框,其推导的693个氨基酸序列中包含6个组氨酸残基构成的2个铜离子结合位点,以及保守的硫羟酸酯区域.Of-PPO属于PP为O2类群,其N端不含信号肽,无跨膜结构域区域,无糖基化位点,44个磷酸化位点均匀分布于整个多肽链中,有2段序列可能形成卷曲螺旋,有5个区域的氨基酸具较强疏水性,其二级结构中α-螺旋占22.54%,随机卷曲占56.79%.同源建模显示其三级结构为"α/β型"中的"滚筒结构",存在一个明显的空位,可能与该酶催化活性有关.本文可为Of-PPO的实验研究和应用开发提供有价值的信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄建华	中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所	31	372	10.0	18.0
2	陆剑锋	合肥工业大学生物与食品工程学院	109	1108	20.0	27.0
3	冯从经	扬州大学园艺与植物保护学院植物保护系	17	155	6.0	12.0
4	郭晓丽	扬州大学园艺与植物保护学院植物保护系	5	16	2.0	4.0
5	桑守亮	扬州大学园艺与植物保护学院植物保护系	4	12	2.0	3.0