猪胸膜肺炎放线杆菌ApxIIA基因的序列分析及其B细胞表位预测

• 作者: 何启盖 李任峰 李学斌 王三虎 王自良 田香勤 赵坤
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪胸膜肺炎放线杆菌 ApxIIA基因 B细胞表位
• 年，卷（期）: 2009,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 104-108,116
• 页数: 6页
• 分类号: S8
• 字数: 3719字
• 语种: 中文

摘要

为了进一步研究猪胸膜肺炎放线杆菌(Actionobacillus pleuropneumoniae,App)ApxIIA基因的结构和功能,选取GenBank中6株不同App分离株,采用生物信息学方法对其ApxIIA基因及其编码氨基酸序列进行同源性比对,并选择其中AY232288.1菌株(湖北分离株)ApxIIA基因为研究对象,分析该基因所编码蛋白质的理化性质,并对其可能形成的二级结构及B细胞表位进行预测和分析.结果表明,6株不同App分离株ApxIIA基因核苷酸及氨基酸序列同源性分别为65.56﹪和88.42﹪,在AY232288.1菌株ApxIIA蛋白的肽链中,745～751和801～807区段可能是其B细胞表位优势区.本研究首次利用生物信息学方法对ApxIIA基因及其蛋白质结构进行了分析和预测,为ApxIIA基因功能的深入研究及APP多表位疫苗的设计奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何启盖	华中农业大学动物医学院农业微生物学国家重点实验室动物病原分室	170	2510	25.0	42.0
2	王自良	河南科技学院动物科学学院	141	803	15.0	20.0
3	赵坤	河南科技学院动物科学学院	76	357	11.0	15.0
4	李学斌	河南科技学院动物科学学院	47	415	8.0	19.0
5	李任峰	河南科技学院动物科学学院	61	206	7.0	12.0
6	王三虎	河南科技学院动物科学学院	89	507	13.0	19.0
7	田香勤	新乡医学院医学研究中心	25	70	4.0	6.0