细菌sRNA基因及其靶标预测研究进展

• 作者: 李伍举 王立贵 赵雅琳
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: sRNA 预测 靶标 细菌
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 小型综述
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 分类号: Q933
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0001-6209.2009.01.002

摘要

细菌sRNA是一类长度在40～500 nt之间的非编码RNA,主要以不完全碱基配对方式与靶标mRNA5′端相互作用进而发挥其生物学功能.鉴于预测方法可以为细菌sRNA及其靶标的实验发现提供指导,因此,细菌sRNA与靶标预测研究受到了广泛重视.文章首先将sRNA预测方法分为3类,分别是基于比较基因组学的预测方法、基于转录单元的预测方法和基于机器学习的预测方法;其次,将sRNA靶标预测方法分为2类,分别是序列比较方法与基于RNA二级结构的预测方法;最后对各类方法的原理、核心思想、优点和局限性进行了分析,并探讨了进一步的发展方向.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李伍举	军事医学科学院基础医学研究所计算生物学中心	19	164	5.0	12.0
2	王立贵	军事医学科学院基础医学研究所计算生物学中心	2	18	2.0	2.0
3	赵雅琳	军事医学科学院基础医学研究所计算生物学中心	1	13	1.0	1.0