利用RAPD和ISSR分子标记对西瓜作图亲本的多态性分析

• 作者: 侯喜林 刘广 徐锦华 羊杏平 高长洲
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 西瓜 RAPD ISSR 体系优化 多态性分析
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 1100-1107
• 页数: 8页
• 分类号: Q78
• 字数: 5766字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2009.05.031

摘要

以西瓜为材料,对基因组DNA的RAPD和ISSR分析体系中的Mg2+、dNTPs和引物浓度进行了优化.筛选出的RAPD优化体系(20 μl)为:引物0.4 μmol/L,dNTPs 200 μmol/L,Mg2+ 2.0 mmol/L,DNA 20 ng,1 × Buffer缓冲液,Tap 酶1.0 U;ISSR优化体系(16 μl)为:引物0.25 μmol/L,dNTPs 160 μmol/L,Mg2+1.0 mmol/L,DNA 20ng,1×Buffer缓冲液,Taq酶0.64 U.以远生态西瓜品种自交系64+1⊕ -3和6⊕-2、及23⊕-1和4-1⊕-2为作图亲本,利用筛选好的RAPD和ISSR体系对作图亲本的多态性进行分析.结果表明,在作图亲本64-1⊕-3和6⊕-2中,181个RAPD引物中有11个引物不能有效扩增,其余170个引物产生了525条扩增带,平均每个引物在基因组中可检测到3.08个基因位点,其中可检测出多态性位点的引物有55个,产生了77条多态性扩增带,平均多态率为14.67%;62个ISSR引物中有17个引物不能有效扩增,其余45个引物产生了188条扩增带,平均每个引物产生了4.18条扩增带,15个多态性引物可以在双亲间检测到多态性位点23个,平均每个多态性引物能扩增出1.53个多态性位点,多态率为12.23%.在作图亲本23⊕-1和4.1⊕-2中,利用499个RAPD引物进行了基因组的扩增,其中43个引物为非有效引物,456个引物产生了1 431条带,平均每个引物产生3.14条带,142个多态性引物检测到了240个多态性基因位点,平均多态率为16.77%.表明西瓜作图亲本问的遗传背景较狭窄.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	侯喜林	南京农业大学园艺学院作物遗传与种质创新国家重点实验室	294	4133	31.0	48.0
2	徐锦华	江苏省农业科学院蔬菜研究所	48	311	10.0	16.0
3	羊杏平	南京农业大学园艺学院作物遗传与种质创新国家重点实验室	75	412	11.0	18.0
5	高长洲	江苏省农业科学院蔬菜研究所	25	197	7.0	13.0
6	刘广	江苏省农业科学院蔬菜研究所	33	265	10.0	15.0