玉米大斑病抗性基因Ht2定位区域内候选序列的生物信息学分析

• 作者: 孙权 崔娜 张春雨 李楠 林凤 武冰冰 许玉凤
• 来源期刊: 玉米科学
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米大斑病 生物信息 候选序列 结构域
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·品种资源
• 页码范围: 11-16
• 页数: 6页
• 分类号: S513.035.3|S435.131
• 字数: 2713字
• 语种: 中文

摘要

利用计算机技术对与玉米大斑病抗性基因Ht2紧密连锁的分子标记umc89和umc48a定位区域内全部序列进行生物信息学分析,共发现101条ORF序列,其中16条ORF序列可编码蛋白质结构域.将这16条序列与已克隆的23条抗病基因核苷酸序列进行BLAST比对及进化树构建,并分析其与已知抗病基因的相似性及亲缘关系.结果发现,序列pco115381g和poo110559-1与编码水稻白叶枯病基因Xa1相似性高、亲缘关系近,而且具有植物抗性基因的高度保守结构域特征,可能与玉米大斑病抗性基因Ht2有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林凤	沈阳农业大学生物科学技术学院	47	584	14.0	22.0
2	许玉凤	沈阳农业大学生物科学技术学院	43	506	14.0	21.0
3	孙权	沈阳农业大学生物科学技术学院	20	105	4.0	10.0
4	崔娜	沈阳农业大学生物科学技术学院	45	428	12.0	20.0
5	李楠	沈阳农业大学生物科学技术学院	33	477	11.0	21.0
6	武冰冰	沈阳农业大学生物科学技术学院	1	3	1.0	1.0
7	张春雨	沈阳农业大学生物科学技术学院	2	14	2.0	2.0