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大豆GmTINY1基因的克隆与表达分析
大豆GmTINY1基因的克隆与表达分析
作者:
何慧
喻德跃
盖钧镒
迟英俊
黄方
原文服务方:
作物学报
大豆
转录因子
AP2
TINY
DREB
摘要:
采用基因芯片技术,从大豆中鉴定了一个荚优势表达基因.利用生物信息学的方法,拼接了该基因的全长序列,并通过RT-PCR克隆了该基因.Blast检索分析表明,该基因编码一个具有AP2结构域的转录因子,且与拟南芥DREB类蛋白TINY的氨基酸相似度最高,将该基因命名为GmTINY1.GmTINY1包含一个735 bp的开放阅读框,编码244个氨基酸残基.GmTINY1与拟南芥TINY和TINY2蛋白的相似度分别为59%与62%.系统发生分析表明,GmTINY1、TINY和TINY2位于一个分支,且同属于DREB亚家族.实时定量RT-PCR检测表明,GmTINY1基因在荚中高丰度表达,在花中的表达量也较高,在根中的表达量较低,而在叶片中未检测到表达.基因芯片信息分析结果表明,GmTINY1在种子发育的子叶期的种脐部分高丰度表达.由此推论,GmTINY1基因在大豆生殖器官发育中可能发挥调控作用,可能与种子发育过程中种脐的形成有关.
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文献信息
篇名
大豆GmTINY1基因的克隆与表达分析
来源期刊
作物学报
学科
关键词
大豆
转录因子
AP2
TINY
DREB
年,卷(期)
2009,(12)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
研究方向
页码范围
2174-2179
页数
6页
分类号
S5
字数
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1006.2009.02174
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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版权信息
全文
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转录因子
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TINY
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
作物学报
主办单位:
中国作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0496-3490
CN:
11-1809/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1950-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
5614
总下载数(次)
0
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英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
江苏省自然科学基金
英文译名:
Natural Science Foundation of Jiangsu Province
官方网址:
http://www.jsnsf.gov.cn/News.aspx?a=37
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