一种基于液相色谱-质谱技术进行血清代谢组学研究的方法:从代谢指纹到潜在标志物

• 作者: 万小平 严沁 单圆鸿 尹沛源 席晓薇 许国旺 赵欣捷 赵素敏 路鑫 陈静
• 来源期刊: 中国科学B辑
• 关键词: 代谢组学 液质联用 宫颈癌 肿瘤标志物
• 年，卷（期）: 2009,（10）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 1268-1276
• 页数: 9页
• 语种: 中文

摘要

本文描述了一种基于液相色谱-质谱技术(LC-MS)的代谢组学发现疾病潜在标志物的方法.该方法利用LC-MS获得代谢指纹图谱,并通过多种统计分析方法对产生的海量数据进行分析,最终筛选出潜在标志物.数据分析过程包括:通过归一化,修正80%规则、数据集分割和数据缩放等方法对数据集进行预处理;通过正交校正的偏最小二乘(OPLS)模式识别方法对样品进行分型;根据模型的变量重要性因子(VIP值)、非参数检验结果和z值筛选潜在标志物.以官颈癌血清样本为例,应用上述方法,15个变量被确认为潜在标志物,操作者接受曲线(ROC)下的面积为0.667～0.956.经过相关性分析和结构鉴定,发现这15个变量来自9个化合物.其中7个化合物被鉴定为色氨酸、硬脂酸、花生四烯酸、溶血磷脂酰胆碱(0:0/16:0,16:0/0:0,18:1/0:0和18:0/0:0),说明在宫颈癌中花生四烯酸和溶血磷脂酰胆碱的代谢发生异常.