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摘要:
本文描述了一种基于液相色谱-质谱技术(LC-MS)的代谢组学发现疾病潜在标志物的方法.该方法利用LC-MS获得代谢指纹图谱,并通过多种统计分析方法对产生的海量数据进行分析,最终筛选出潜在标志物.数据分析过程包括:通过归一化,修正80%规则、数据集分割和数据缩放等方法对数据集进行预处理;通过正交校正的偏最小二乘(OPLS)模式识别方法对样品进行分型;根据模型的变量重要性因子(VIP值)、非参数检验结果和z值筛选潜在标志物.以官颈癌血清样本为例,应用上述方法,15个变量被确认为潜在标志物,操作者接受曲线(ROC)下的面积为0.667~0.956.经过相关性分析和结构鉴定,发现这15个变量来自9个化合物.其中7个化合物被鉴定为色氨酸、硬脂酸、花生四烯酸、溶血磷脂酰胆碱(0:0/16:0,16:0/0:0,18:1/0:0和18:0/0:0),说明在宫颈癌中花生四烯酸和溶血磷脂酰胆碱的代谢发生异常.
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文献信息
篇名 一种基于液相色谱-质谱技术进行血清代谢组学研究的方法:从代谢指纹到潜在标志物
来源期刊 中国科学B辑 学科
关键词 代谢组学 液质联用 宫颈癌 肿瘤标志物
年,卷(期) 2009,(10) 所属期刊栏目 论文
研究方向 页码范围 1268-1276
页数 9页 分类号
字数 语种 中文
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中国科学(化学)
月刊
1674-7224
11-5838/O6
北京东黄城根北街16号
chi
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3133
总下载数(次)
8
相关基金
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:http://www.863.org.cn
项目类型:重点项目
学科类型:信息技术
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