应用激光捕获显微切割技术纯化的鼻咽癌蛋白质表达谱的建立

• 作者: 张鹏飞 彭芳 李峰 李美香 李茂玉 李萃 汤参娥 程爱兰 肖志强 陈主初
• 来源期刊: 中南大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 鼻咽癌 蛋白质表达谱 蛋白质组数据库 激光捕获显微切割 二维凝胶电泳 质谱
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 481-486
• 页数: 6页
• 分类号: R739.63
• 字数: 4011字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1672-7347.2009.06.004

摘要

目的:建立鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)蛋白质表达谱,为NPC蛋白质组学研究奠定基础.方法:应用激光捕获显微切割(laser capture microdissection,LCM)技术从NPC组织纯化NPC细胞,应用二维凝胶电泳(2-DE)分离LCM 纯化NPC细胞的蛋白质,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定蛋白质,利用生物信息学资源构建NPC的2-DE蛋白质组数据库. 结果:建立了NPC蛋白质2-DE参考图谱,2-DE图谱共显示(1 312±30)个蛋白质点,共鉴定了427个蛋白质点,包括241个非冗余蛋白质,并构建了NPC的2-DE蛋白质组数据库,这些数据可从本实验室网站(http://www.xyproteomics.org)上进行查询.结论:首次建立了LCM纯化NPC细胞2-DE蛋白质表达谱,为NPC蛋白质组学研究提供了重要的信息和资料.