猪繁殖与呼吸综合征流行株ORF5基因遗传变异分析

• 作者: 孙婕 尹国友 苏景 赵祯 陈兰英
• 来源期刊: 农业科学与技术（英文版）
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF5基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 农业生物技术
• 页码范围: 88-91
• 页数: 4页
• 分类号: S8
• 字数: 1302字
• 语种: 英文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-4229-B.2009.05.022

摘要

[目的]分析猪繁殖与呼吸综合症(PRRS)发病原因、流行趋势,为预防和控制PRRSV提供理论依据.[方法] 根据GenBank上的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ATCC VR-2332的全基因序列,设计并合成引物,采用RT-PCR技术扩增了7株流行株(HLJ10,HLJ48,HLJ64,HLJ76,HLJ77,HLJ85,HLJ87)中的ORF5基因序列.应用DNAStar软件分析所测序列,并与ATCC VR-2332、CH-1a、BJ-4、LV及疫苗株MLV进行序列比较.同时用系统进化树分析了分离株之间的亲缘关系.[结果] 核苷酸序列分析表明这7株流行株中ORF5基因与VR-2332、CH-1a、BJ-4等代表株的同源性分别为88.1%～98.8%,89.9%～95.2%,85.6%～98.7%;与LV的同源性为54.7%～56.9%.氨基酸序列分析表明这7株流行株与VR-2332、CH-1a、BJ-4等代表株的同源性分别为88.1%～96.8%,88.1%～94.5%,86.1%～96.5%;与LV的同源性为54.7%～56.2%.通过系统发育进化树分析可知HLJ48、HLJ64、HLJ76、HLJ77、HLJ85与CH-1株亲缘关系密切,同属一亚群,表明所获得的毒株与参考株CH-1亲缘关系较近,可能由CH-1演化而来.HLJ10、HLJ87与疫苗株MLV关系较近,而且HLJ10、HLJ87的同源性高达100%,可能由于使用疫苗而感染,说明黑龙江省存在疫苗毒的隐性感染.[结论] 流行株在ORF5基因区域的变异较大,同一地域分离株间ORF5基因序列同源性较高且亲缘关系较近,不同地域则较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈兰英	河南城建学院生物工程系	46	224	8.0	12.0
2	赵祯	河南城建学院生物工程系	3	13	3.0	3.0
3	尹国友	河南城建学院生物工程系	44	195	8.0	12.0
4	孙婕	河南城建学院生物工程系	50	208	8.0	12.0
5	苏景		23	41	4.0	5.0