基于基因重测序信息的大豆基因靶向CAPS标记开发

• 作者: 才华 朱延明 李勇 束永俊 柏锡 纪巍
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 大豆 重测序数据 单核苷酸多态性 酶切扩增多态性序列 基因靶向功能标记
• 年，卷（期）: 2009,（11）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 2015-2021
• 页数: 7页
• 分类号: S3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.02015

摘要

为了开发大豆基因靶向的功能分子标记,本研究采用生物信息学方法分析了大豆基因重测序数据,筛选出酶切位点突变的SNP位点,设计PCR引物163对,选用东北地区主栽品种绥农14的DNA为模板进行PCR扩增,其中139对引物获得大小为400～1 200 bp的特异片段.以大豆绥农14、合丰25、Acher、Evans、Peking、P1209332、固新野生大豆、科丰1号和南农1138-2的DNA为模板,采用筛选的139对引物进行PCR扩增,对扩增产物进行酶切分析,发现73对引物的PCR产物具有酶切多态性,开发出CAPS标记73个.通过功能注释分析发现,这73个CAPS标记靶向的基因主要参与细胞内亚细胞定位过程、蛋白质的结合与催化以及代谢过程等,与大豆重要农艺性状的形成相关,可以用于大豆品种的鉴定和分子系统进化的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李勇	东北农业大学生命科学学院	41	568	14.0	22.0
2	柏锡	东北农业大学生命科学学院	80	891	15.0	26.0
3	才华	东北农业大学生命科学学院	63	619	14.0	22.0
4	纪巍	东北农业大学生命科学学院	44	518	13.0	21.0
5	朱延明	东北农业大学生命科学学院	125	1696	22.0	34.0
6	束永俊	东北农业大学生命科学学院	9	112	5.0	9.0