nanoLC-ESI/MS/MS在ECV304细胞蛋白质组学研究中的应用

• 作者: 季煜华 曾耀英 李菊玲 杜彬
• 来源期刊: 中国病理生理杂志
• 学科: 医学
• 关键词: nanoLC-ESI/MS/MS技术 ECV304细胞 蛋白质组
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 实验技术
• 页码范围: 205-208
• 页数: 4页
• 分类号: R34
• 字数: 2517字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-4718.2009.01.046

摘要

目的:应用纳升液联用技术(nanoLC-ESI/MS/MS)对ECV304细胞蛋白质组学进行初步分析.方法:提取ECV304细胞总蛋白,经变性、还原、烷基化和酶解,nanoLC-ESI/MS/MS对酶解后的肽段进行分析,数据库(Swissprot)检索鉴定蛋白质,生物信息学工具对所鉴定的蛋白质进行细胞定位和功能分类.结果:从8μg 细胞总蛋白中鉴定了120种蛋白质,所鉴定蛋白质的分子质量(MW)范围从6648 D至280 739 D,MW<20 kD的蛋白质占24.2%,MW>100 kD的蛋白质占5.0%;主要位于细胞质、细胞骨架、细胞核和细胞膜,分别为27.8%、19.0%、15.2%和10.1%;大多为结构蛋白质和催化活性的蛋白质,分别为36.4%和34.1%,具有信号转导活性的占11.4%;其中角蛋白8、18和vimentin等为内皮细胞特异表达的蛋白质.结论:本研究建立了nanoLC-ESI/MS/Ms分析ECV304细胞的蛋白质组学方法,为内皮细胞及内皮细胞损伤机制的蛋白质组学研究奠定了实验基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾耀英	暨南大学组织移植与免疫中心	300	2350	22.0	32.0
2	季煜华	暨南大学组织移植与免疫中心	40	200	7.0	12.0
3	杜彬	暨南大学医学院	27	225	8.0	13.0
4	李菊玲	复旦大学上海医学院病理学系	1	4	1.0	1.0