甘蔗NBS-LRR类抗病基因同源序列的分离与鉴定

• 作者: 林剑伟 许莉萍 阙友雄 陈如凯
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 甘蔗 NBS-LRR 抗病基因同源序列
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 631-639
• 页数: 9页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.00631

摘要

根据已知植物(拟南芥、烟草和亚麻)抗病基因(RGAs)保守序列设计简并引物,从甘蔗高抗黑穗病品种NCo376的基因组DNA和cDNA中扩增出11条抗病基因同源序列,其中5条来自基因组DNA(EF059973、EF059974、EF059975、EF059976和EF059977),6条来自cDNA(EF155648、EF155649、EF155650、EF155651、EF155652和EF155653).序列分析表明,这些RGAs均含有典型的NBS-LRR类抗病基因所拥有的保守结构域P-loop、Kinase-2a、Kinase-3a和疏水结构域.聚类分析表明,11条RGA同RPS2和XA1聚为一类,而N和L6则单独聚为一类.所有11条抗病基因同源序列中,kinase-2(LLVLDDVW/D)最后一个氨基酸皆为色氨酸.定量PCR分析表明,编号为EF059974的PIC基因的表达不仅受黑穗病菌胁迫的影响,而且受水杨酸的诱导和过氧化氢的抑制,也具有抗病基因组织特异性和组成型表达特性.