甘蔗中一个NBS-LRR类基因的全长克隆与表达分析

• 作者: 张木清 张积森 徐景升 许莉萍 阙友雄 陈如凯
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 甘蔗 分子克隆 抗病基因 定量PCR
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1161-1166
• 页数: 6页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01161

摘要

采用RACE技术,从甘蔗高抗黑穗病品种NCo376中克隆了一个NBS-LRR类基因的cDNA全长序列,命名为SNLR.生物信息学分析显示,甘蔗SNLR基因的cDNA全长为2 985 bp(GenBank登录号为EF155654),包括一个2 661 bp的完整开放读码框以及一个典型的29 bp poly-A.同时,还具有NBS-LRR类抗病基因的所有保守结构域,包括4个NBS区域保守结构域和6个潜在LRR结构域;蛋白疏水性分析和二级、三级结构分析表明,该基因编码的蛋白质为弱碱性蛋白,pI为7.76,无明显的疏水结构域,以卷曲结构和螺旋结构为骨架,三级结构未见明显的跨膜信号蛋白区.定量PCR分析表明,甘蔗SNLR基因的表达受到黑穗病菌、水杨酸和过氧化氢的影响,分别表现出"抑-扬"、"全程抑制"和"扬-抑"的表达模式,也具有抗病基因组成型和组织特异性表达的特点.推测甘蔗SNLR基因可能为抗病相关基因.