小菜粉蝶颗粒体病毒lef-3基因的克隆与分析

• 作者: 孟祥坤 曹广力 朱越雄 薛仁宇 贡成良
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 小菜粉蝶颗粒体病毒 晚期基因表达调控因子LEF-3 单链DNA结合蛋白 进化起源
• 年，卷（期）: 2009,（12）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 4411-4419
• 页数: 9页
• 分类号: S4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.12.037

摘要

[目的]研究杆状病毒lef-3基因的起源与进化,从分子水平明确病毒之间的亲缘关系.[方法]通过常规PCR方法获得小菜粉蝶颗粒体病毒晚期基因表达调控因子,lef-3的基因片段,克隆后测序,然后利用软件对lef-3及编码序列进行生物信息学分析.[结果]克隆得到的PiraGV lef-3基因ORF序列中存在4个突变位点,但氨基酸性质未发生改交,推导PiraGV LEF-3蛋白含399个氨基酸残基,分子量为3.99 kD;通过高级结构预测及其编码序列与其它杆状病毒的LEF-3同源性比对表明,该基因可能编码单链DNA结合蛋白;BLAST比对发现lef-3基因只存在于鳞翅目昆虫为宿主的杆状病毒基因组;进化分析表明LEF-3可分为3组,其中GV属的LEF-3聚类为1个组,NPV属的LEF-3聚类为2个组;GV的lef-3基因编码区的选择压力分析表明,大多数lef-3基因间相比较表现为负向选择,但不同lef-3基因问的Ka/Ks不同,也有正向选择;起源分析表明,杆状病毒lef-3基因可能来源于细菌.[结论]获得了小菜粉蝶颗粒体病毒(PiraGV)lef-3基因,通过生物信息学分析推测出了lef-3基因的起源进化规律.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛仁宇	苏州大学医学部	110	944	17.0	24.0
2	贡成良	苏州大学医学部	136	1227	19.0	27.0
3	曹广力	苏州大学医学部	136	1198	19.0	28.0
4	朱越雄	苏州大学医学部	73	491	13.0	19.0
5	孟祥坤	苏州大学医学部	5	10	2.0	3.0