喀斯特原生土壤与退化生态系统土壤细菌群落结构

• 作者: 代晓燕 何寻阳 苏以荣 陈香碧 魏亚伟 魏文学
• 来源期刊: 应用生态学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 喀斯特 16SrDNA 细菌多样性 基因型 PCR-RFLP 系统发育
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 页码范围: 863-871
• 页数: 9页
• 分类号: Q938.1
• 语种: 中文

摘要

运用PCR-RFLP技术,对桂西北喀斯特原生土壤和退化生态系统土壤细菌16S rDNA基因多样性及系统发育关系进行了研究.结果表明:原生土壤比退化生态系统土壤具有更丰富的16S rDNA基因型和更高的多样性指数,两样地共有的基因型仅有2个.从每种基因型中随机选择一个克隆子作为代表进行测序分析,所有序列与GenBank 数据库中序列的同源性为87%～100%,且两样地中均有超过一半的基因型序列与数据库中已知序列同源性低于97%,属于分类在"种"地位上的新发现细菌;通过系统发育研究将两样地的细菌分为10大类群,两样地共同拥有5大类群,但两样地的细菌优势类群明显不同,原生土壤为Proteobacteria,含39种基因型,占总克隆子数的58.0%,退化生态系统土壤为Acidobacteria和Proteobacteria,分别含19种和15种基因型,占总克隆子数的32.5%和30.5%;与原生土壤细菌类群相比,退化生态系统土壤Proteobacteria类群明显减少,Acidobacteria类群明显增加.土壤理化性质及土壤环境因素的差异是引起两类型土壤细菌多样性差异的原因.