链状亚历山大藻共附生细菌多样性

• 作者: 刘兵 史西志 叶倩 李太武 李宇 李登峰 苏秀榕 陈燕
• 来源期刊: 生态学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 链状亚历山大藻 16S rDNA RFLP 细菌多样性
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 页码范围: 889-894
• 页数: 6页
• 分类号: Q93
• 语种: 中文

摘要

采用非分离培养分析方法,直接提取链状亚历山大藻(Alexandrium catenella)共附生细菌总DNA,以之为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA基因片段,并构建16S rDNA克隆文库.通过16S rDNA限制性酶切片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)和测序方法对链状亚历山大藻共附生细菌的多样性进行了研究.84个16S rDNA克隆片段经限制性内切酶HaeⅢ酶切分析,得到30种不同的酶切指纹类型.挑选50个克隆子进行测序获得其16S rDNA部分序列,并对16S rDNA序列进行聚类分析构建了系统进化树.结果表明,链状亚历山大藻共附生的细菌多样性较强,优势细菌类群为变形菌α亚群(α-Proteobacteria)和拟杆菌(Bacteroidetes),其中玫瑰杆菌(Roseobacter sp.)在α-Proteobacteria中占绝对优势.