基于illumina测序技术的IGROV-1/CP细胞中miRNA种类鉴定及相对丰度分析

• 作者: 张政希 徐学敏 李伟 林标扬 莫凡 郭妍
• 来源期刊: 分析测试学报
• 学科: 医学
• 关键词: 卵巢癌 顺铂耐药性 IGROV-1/CP细胞系 miRNA illumina测序技术
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 129-134
• 页数: 6页
• 分类号: R737.31
• 字数: 4461字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-4957.2009.02.001

摘要

从正常培养的IGROV-1/CP细胞中提取小RNA,构建小RNA的cDNA文库,然后用illumina通用测序平台对上述cDNA文库进行测序.从测序获得的序列数据中去除冗余数据后,与已知人类miRNA序列数据库进行比对,获得IGROV-1/CP细胞miRNA表达谱.以所获的序列长度与已知人类miRNA数据库中序列长度差异不大于2和无碱基错配为限制条件,共找到53种已知miRNA.按在cDNA文库测序中的出现频率计算,出现频率不大于10的低拷贝miRNA最多,占检测到所有miRNA种类的56.6%.说明illumina通用测序技术能够在检测细胞内的各种小RNA序列的同时反应相对丰度信息,该研究利用上述新技术获得了顺铂耐药性IGROV-1/CP细胞系miRNA表达种类和相对丰度的实验数据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李伟	上海交通大学系统生物医学研究院	143	563	13.0	19.0
2	郭妍	上海交通大学系统生物医学研究院	10	25	4.0	5.0
3	徐学敏	上海交通大学系统生物医学研究院	16	102	5.0	10.0
4	张政希	上海交通大学系统生物医学研究院	5	11	2.0	3.0
5	林标扬	上海交通大学系统生物医学研究院	4	6	2.0	2.0
6	莫凡	浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院	2	7	2.0	2.0