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基于illumina测序技术的IGROV-1/CP细胞中miRNA种类鉴定及相对丰度分析
基于illumina测序技术的IGROV-1/CP细胞中miRNA种类鉴定及相对丰度分析
作者:
张政希
徐学敏
李伟
林标扬
莫凡
郭妍
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
卵巢癌
顺铂耐药性
IGROV-1/CP细胞系
miRNA
illumina测序技术
摘要:
从正常培养的IGROV-1/CP细胞中提取小RNA,构建小RNA的cDNA文库,然后用illumina通用测序平台对上述cDNA文库进行测序.从测序获得的序列数据中去除冗余数据后,与已知人类miRNA序列数据库进行比对,获得IGROV-1/CP细胞miRNA表达谱.以所获的序列长度与已知人类miRNA数据库中序列长度差异不大于2和无碱基错配为限制条件,共找到53种已知miRNA.按在cDNA文库测序中的出现频率计算,出现频率不大于10的低拷贝miRNA最多,占检测到所有miRNA种类的56.6%.说明illumina通用测序技术能够在检测细胞内的各种小RNA序列的同时反应相对丰度信息,该研究利用上述新技术获得了顺铂耐药性IGROV-1/CP细胞系miRNA表达种类和相对丰度的实验数据.
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文献信息
篇名
基于illumina测序技术的IGROV-1/CP细胞中miRNA种类鉴定及相对丰度分析
来源期刊
分析测试学报
学科
医学
关键词
卵巢癌
顺铂耐药性
IGROV-1/CP细胞系
miRNA
illumina测序技术
年,卷(期)
2009,(2)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
129-134
页数
6页
分类号
R737.31
字数
4461字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1004-4957.2009.02.001
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李伟
上海交通大学系统生物医学研究院
143
563
13.0
19.0
2
郭妍
上海交通大学系统生物医学研究院
10
25
4.0
5.0
3
徐学敏
上海交通大学系统生物医学研究院
16
102
5.0
10.0
4
张政希
上海交通大学系统生物医学研究院
5
11
2.0
3.0
5
林标扬
上海交通大学系统生物医学研究院
4
6
2.0
2.0
6
莫凡
浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院
2
7
2.0
2.0
传播情况
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参考文献(2)
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参考文献(2)
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参考文献(8)
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参考文献(0)
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引证文献(0)
二级引证文献(0)
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引证文献(1)
二级引证文献(0)
2012(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
2013(2)
引证文献(2)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
卵巢癌
顺铂耐药性
IGROV-1/CP细胞系
miRNA
illumina测序技术
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
分析测试学报
主办单位:
中国广州分析测试中心
中国分析测试协会
出版周期:
月刊
ISSN:
1004-4957
CN:
44-1318/TH
开本:
大16开
出版地:
广州市先烈中路100号
邮发代号:
46-104
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
6306
总下载数(次)
8
总被引数(次)
62582
相关基金
上海市科委纳米专项基金
英文译名:
官方网址:
项目类型:
学科类型:
期刊文献
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