斑茅NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆与分析

• 作者: 张木清 林剑伟 许莉萍 阙友雄 陈如凯
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 班茅 保守区域 抗病基因同源序列 简并引物
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 作物病虫害及其防治
• 页码范围: 192-197
• 页数: 6页
• 分类号: S566|Q781
• 字数: 5382字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2009.02.015

摘要

根据已知NBS-LRR抗病基因[含有核苷酸结合位点(NBS)和富亮氨酸重复(LRR)的胞内受体蛋白基因1NBS结构域蛋白质的保守序列,设计简并引物,对斑茅基因组进行体外扩增,获得了对应区段的DNA片段,回收、克隆这些特异片段,测序分析,共获得8个片段序列.序列分析发现其中7个编号分别为RGA-Q1、RGA-Q2、RGA-Q3、RGA-Q4、RGA-Q5、RGA-Q6和RGA-Q7的片段推导的氨基酸序列均具有典型的NBS结构域,即Ploop(GGVGKTr)、Kinase-2a(VLDDVW)、Kinase-3a(GSR/KILVTTR)及疏水结构域HD(hydrophobic domain).它们在NCBI上的登录号为EU685828、EU685829、EU685830、EU685831、EU685832、EU685833和EU685834.这些抗病基因同源片段(RGA)与已经克隆的N、L6、RPS2和胧等11个抗病基因在氨基酸水平上的同源性为2.3%～39.8%.可进一步用作斑茅抗病候选基因的分子筛选及遗传图谱的构建.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈如凯	福建农林大学农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室	125	1780	20.0	34.0
2	张木清	福建农林大学农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室	64	1517	23.0	37.0
3	阙友雄	福建农林大学农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室	41	502	13.0	21.0
4	许莉萍	福建农林大学农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室	59	686	15.0	23.0
5	林剑伟	福建农林大学农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室	5	124	4.0	5.0