应用GDPs转录物标记法进行水稻白叶枯病菌早期侵染表达谱分析

• 作者: 何晨阳 吴茂森 张新建 高世强
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻白叶枯病菌 GDPs 侵染早期 表达谱 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2009,（10）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 3501-3508
• 页数: 8页
• 分类号: S4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.10.0015

摘要

[目的] 揭示水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzse pv.oryzae,Xoo)在侵染水稻叶组织早期的基因表达谱差异.[方法] 采用GDPs-Finder计算法,设计了能够覆盖KACC10331基因组全部ORFs的定向引物(GDPs),对Xoo与水稻互作1、3和7 d的总RNA进行反转录,对病菌cDNA探针进行Cy3/Cy5选择性标记,与含有371个Xoo致病相关基因的芯片进行杂交.[结果] 在水稻侵染的不同时期,Xoo致病相关基因表达谱存在差异.与在NBY中生长相比,Xoo在侵染1、3和7 d时分别有42个(18个上调和23个下调)、51个(29个上调和22个下调)和33个(16个上调和17个下调)基因发生了差异表达;其中5个基因是共有上调表达的,5个是共有下调表达的.推测这些基因的差异表达可能与病菌适应寄主体内环境、生长与定殖以及为害与显症过程有关.[结论] 应用GDPs转录物标记技术可以成功地进行Xoo侵染过程的表达谱分析,鉴定出的差异表达的基因可以作为功能研究的靶标基因.