在铜绿假单胞菌PA01和PA14中确定基因岛的新方法

• 作者: 宋磊 张雪洪
• 来源期刊: 科学通报
• 关键词: 铜绿假单胞菌 基因岛 基因水平转移 比较基因组分析 整合酶
• 年，卷（期）: 2009,（20）
• 所属期刊栏目: 论文3
• 页码范围: 3198-3206
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1007/s11434-009-0598-0

摘要

基于基因岛的3种显著特点,建立了一种新的确定基因岛的方法,能够较为全面地搜寻特定菌株的基因岛.以此方法在Pseudomonas aeruginosa PA14和Pseudomonas aeruginosa PAO1中共发现了9个基因岛,在PAO1中发现2个,在PA14中发现7个,其中有4个是已经被研究鉴定,5个是新发现的基因岛.9个基因岛中,有6个的插入位点是tRNA基因,而其余的3个基因岛中有1个正向重复序列同tRNA基因相关,1个的正向重复序列是在GMP合酶/谷氨酰胺氨基转移酶双功能酶的3'末端,只有1个的正向重复序列尚不清楚来源.对5个未被鉴定的基因岛进行内部基因的功能分析,预测PA14GI-2是同汞离子摄取相关的基因岛,PA14GI-3是同分泌相关的基因岛,PA14GI-6是毒力岛.而PA14GI-1和PA14GI-5功能尚不清楚.对PAO1GI-1,PA14GI-5和PA14GI-7中的整合酶进行分析,预测了各基因岛的酶切位点和结合位点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张雪洪		77	506	13.0	19.0
2	宋磊		14	137	4.0	11.0