西方蜜蜂(Apis mellifera L.)sRNA的富集与文库检测

• 作者: 俞晓敏 胡福良 蔡亦梅 郑火青 陈璇
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 西方蜜蜂(Apis mellifera L.) sRNA富集 miRNA文库 直接克隆法 高通量测序
• 年，卷（期）: 2009,（8）
• 所属期刊栏目: 畜牧·资源昆虫
• 页码范围: 2943-2948
• 页数: 6页
• 分类号: S8
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.08.037

摘要

[目的]提取及扩增蜜蜂(Apis mellifera L)sRNA,并构建文库检测富集结果是否满足高通量测序研究要求.[方法]取蜜蜂3个级型不同发育阶段个体作为材料,分别提取总RNA后混合,从中分离出15～40nt的sRNA,反转成cDNA后构建文库,进行蓝白斑筛选.挑选288个单克隆进行测序,对测序结果进行分析.[结果]有效序列为214条,插入的cDNA片段大小范围为15～39 bp.其中,sme-miR-71c miRNA 65条,ncRNA(包括tm-RNA,intron-ghI、5.8s rRNA)5条,tRNA 28条,siRNA及其他sRNA 33条,CDS 1条,未知序列82条.[结论]本实验采用的方法能有效富集蜜蜂sRNA,能够满足高通量测序从中识别出蜜蜂miRNA的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡福良	浙江大学动物科学学院	390	2151	20.0	30.0
2	郑火青	浙江大学动物科学学院	81	383	11.0	17.0
3	陈璇	浙江大学动物科学学院	10	36	3.0	5.0
4	俞晓敏	中国科学院北京基因组研究所基因组信息与科学重点实验室	3	2	1.0	1.0
5	蔡亦梅	中国科学院北京基因组研究所基因组信息与科学重点实验室	1	2	1.0	1.0