分子动力学中平行六面体的邻位算法

• 作者: 孙毅 崔志伟 曲建民
• 来源期刊: 科学通报
• 关键词: 分子动力学模拟 邻位算法 平行六面体盒子
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 734-739
• 页数: 6页
• 语种: 中文

摘要

在分子动力学模拟中,Verlet列表法、元胞链接列表法和其他一些改进的算法已经被用来提高计算效率.然而,这些方法大部分应用在立方体系.本文扩展了原始算法的应用领域,使其适用于NP系综,并可以在外载荷作用下进行系统仿真.此外,对于Metric-tensor的压强算法提出相应的标度矩阵,使得邻位算法可以应用在新的压强算法上.同时,还针对平行六面体盒子提出了一种联合算法.该方法综合了改进的Verlet列表法和元胞列表法的优点,可以快速确定平行六面体盒子中每个原子的邻位原子,从而提高仿真速度.最后,利用Lennard-Jones势函数的分子动力学模拟实验验证了本算法的有效性和正确性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙毅		79	572	12.0	20.0
2	崔志伟		3	3	1.0	1.0
3	曲建民		1	0	0.0	0.0